Итак, у меня есть Экспериментальная Сущность, у которой много объектов RNASeq. Однако, когда я пытаюсь сохранить эксперимент с записью RNASeq (через newAction ), сохраняется только часть эксперимента.
Мой контроллер выглядит следующим образом:
<?php // src/AppBundle/Controller/ExperimentController.php namespace AppBundle\Controller; use AppBundle\Entity\Experiment; use AppBundle\Entity\RNASeq; use AppBundle\Form\Type\ExperimentType; use Symfony\Bundle\FrameworkBundle\Controller\Controller; use Symfony\Component\HttpFoundation\Request; use Sensio\Bundle\FrameworkExtraBundle\Configuration\Route; use Symfony\Component\HttpFoundation\Response; // TODO: deleteAction should be implemented. class ExperimentController extends Controller { /** * @Route("/experiment/index", name="experiment_index") */ public function indexAction() { // Grab all experiments from database and hand them to template. $repository = $this->getDoctrine()->getRepository('AppBundle:Experiment'); $experiments = $repository->findAll(); return $this->render('experiment/index.html.twig',['experiments' => $experiments]); } /** * @Route("/experiment/new", name="experiment_new") */ public function newAction(Request $request) { $experiment = new Experiment(); $form = $this->createForm(ExperimentType::class, $experiment); $form->handleRequest($request); // On submission. if ($form->isValid()) { $em = $this->getDoctrine()->getManager(); $em->persist($experiment); // For each nested object. foreach($experiment->getRNASeqs() as $rnaseq) { $em->persist($rnaseq); } $em->flush(); return $this->redirectToRoute('experiment_index'); } return $this->render('experiment/form.html.twig', array('form' => $form->createView())); } /** * @Route("/experiment/show/{id}", name="experiment_show") * TODO: Not sure if nessesary (wasn't in last system). */ public function showAction($id) { return $this->render('experiment/show.html.twig'); } /** * @Route("/experiment/edit/{id}", name="experiment_edit") */ public function editAction(Request $request, $id) { $repository = $this->getDoctrine()->getRepository('AppBundle:Experiment'); $experiment = $repository->find($id); $form = $this->createForm(ExperimentType::class, $experiment); $form->handleRequest($request); return $this->render('experiment/form.html.twig', array('form' => $form->createView())); } } ?>
Я попытался следовать документации Symfony . Тем не менее, он специально не рассматривает пример «один-ко-многим», и я боюсь, что это возможно, где я испортился.
Для краткости мои классы Entity и остальная часть моего кода можно найти здесь .
Редактировать:
Я заметил, что во время события создания insert into события, похоже, не имеет правильных атрибутов отношений:
INSERT INTO experiment (title, exp_type, sample_nums) VALUES (?, ?, ?) Parameters: { 1: fe, 2: RNASeq, 3: 'a:1:{i:0;i:68767;}' } INSERT INTO rnaseq (quality, ribodepleted, final_quality, sample_num, protocol_used, step1, step1result, service_provider, platform, data_files, pipeline, pipeline_parameters, result_files, experiment_id) VALUES (?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?) Parameters: { 1: fds, 2: 0, 3: fes, 4: 7876, 5: esf, 6: 0, 7: fsd, 8: fs, 9: fs, 10: fsd, 11: sdf, 12: fds, 13: fsd, 14: null }
Experiment похоже, не обновляет свой атрибут rnaSeqs , а RNASeq имеет null параметр для experiment_id .
Это очень распространенная проблема. Вам нужно позаботиться о перекрестных ссылках на ваши объекты. Doctrine не делает это автоматически, хотя многие люди изначально, похоже, думают, что это произойдет.
class Experiment { public function addRNASeq($seq) { $this->seqs[] = $seq; $seq->setExperiment($this); // This is what you are missing
И добавьте атрибут cascade = all в свойство Experiment :: seqs. Тогда вам не нужно явно сохранять объекты seq.