PHP Lang

Articles of биоинформатика

Выполнение внешней программы BLAST в PHP

Я хочу выполнить приложение поиска blastx в PHP вместо текстового терминала консоли Linux. Фактические аргументы командной строки будут ( см. Определение ссылки ): ./blastx -query $input -db ${Sbjct}_db -evalue 0.0001 -outfmt 6 -out /path/to/output.tsv Вот мой PHP-код. exec(' /path/to/blastx -query /path/to/PAO1.fasta -db /path/to/VFDB_setB_pro -evalue 0.0001 -outfmt 6 -out /path/to/output.tsv '); Однако, когда я вызываю функцию […]
Intereting Posts
file_get_contents ('php: // input') всегда возвращает пустую строку Symfony2: реализация локального коммутатора без сеанса / контроллера Как перенаправить на ту же страницу в PHP Как вы можете определить, ограничена ли коллекция? Запущено приложение PHP Удаление строки с внутренним соединением Могу ли я использовать URL-адрес в качестве источника для imagecreatefromjpeg () без включения оберток fopen? Использование имени домена вместо localhost внутри с https в xampp $ subject в почтовой форме php, возвращающей только первое слово в строке mySqli Bind Parameter LIKE с подстановочным знаком Идентификация имен столбцов в операторах PDO Как создать входы / элементы формы в ZF2 Игнорировать последние взорванные данные? PHP Вопросы, касающиеся таблиц и объединенного / связанного содержимого; CodeIgniter Стиль не отображается при вызове с использованием идентификатора страницы в wordpress