У меня есть куча запросов, которые генерируются сценарием оболочки на одном сервере и должны потребляться приложением CI на другом сервере. Запросы выполняются нормально, когда запускаются индивидуально, но не работают при запуске в виде пакета. Есть ли выход? Обратите внимание, что это не множественные вставки или обновления, и запросы могут охватывать более одной строки
Это не ограничение CodeIgniter, а скорее клиентских библиотек базы данных.
Т.е. mysql_query() может выполнять только один запрос за раз.
В зависимости от клиента есть альтернативы,
Т.е., mysqli_multi_query()